A genética molecular tem revelado importantes aplicações na conservação de espécies e em outros campos da biologia, como a taxonomia e evolução. Através do acesso à variabilidade genética é possível obter diversas informações a respeito do status da população, como o grau de endogamia e o seu tamanho efetivo (N_e). Também é possível a identificação de indivíduos e populações, distinção de espécies, monitoramento de hibridização interespecífica e outros processos, o que tem permitido um grande aprimoramento tanto no manejo in situ quanto ex situ de populações ameaçadas.