Rasmol  (2a parte)

SIGA AS INSTRUÇÕES ABAIXO, PASSO A PASSO!
 

1. Com as janelas devidamente posicionadas, vamos abrir uma molécula no RASMOL: clique no menu "FILE" e depois em "OPEN". Abra o arquivo "myoglobin.pdb";
2. A molécula está representada na forma "Wireframe". Com o mouse, pode-se controlar a movimentação da molécula na tela. Experimente:

Ação	Mouse
Mover nos eixos X e Y	Botão Esquerdo
Arrastar a molécula	Botão Direito
Mover no eixo Z	Shift+Botão Direito
Zoom	Shift+Botão Esquerdo

3. A janela de comando (fundo branco) é onde se deve digitar os comandos para que o rasmol execute determinadas tarefas. Vamos começar por mudar o modo de exibição de "Wireframe" para "Ribbon". Para tanto, digite na janela de comando:
• select protein <enter>
• color group <enter>
4. Vá agora ao menu e clique em "Display" e em "Ribbon". Agora vê-se a estrutura mais nitidamente, não é?
5. Gire a molécula. O que há de curioso?
6. Vamos selecionar o que há de curioso... na janela de comando, digite:
• select hetero <enter> (assim você está selecionando apenas o que não é proteína)
• spacefill <enter>
7. Agora o heme está destacado, num modo de exibição denominado "Spacefill". Vamos continuar no heme: gire a molécula de modo a deixar o heme bem visível;
8. Digite na janela de comando:
• color white <enter>
• select iron <enter>
• color orange <enter>
9. Clique no átomo que se tornou alaranjado e observe a janela de comando. O que você lê nela? Exatamente, a identificação do átomo - Ferro;
10. Digite na janela de comando:
• select hetero <enter>
• color cpk <enter>