Rasmol
(3a parte)
SIGA
AS INSTRUÇÕES ABAIXO, PASSO A PASSO!
-
Olhando para a estrutura
da mioglobina com seu heme, você pode ver alguma ligação
entre o grupamento prostético e a proteína? Digite na janela
de comando:
-
Vá ao menu "Display"
e clique em "Backbone". Essa representação mostra apenas
os carbonos-alfa, conectados por uma ligação hipotética.
Digite na janela de comando:
-
select 64 <enter>
-
color yellow <enter>
-
wireframe .4 <enter>
(atenção! Há mesmo um ponto antes do 4!)
-
select 93 <enter>
-
color green <enter>
-
wireframe .4 <enter>
-
O que aconteceu? Quais
aminoácidos são esses? Clique em cima deles e descubra.
-
PAUSA
-
Digite na janela de
comando:
-
Vá o menu "Display"
e clique em "Backbone". Vá ao menu "Colours" e selecione "Structure".
-
Digite na janela de
comando:
-
select 64, 93 <enter>
-
color green <enter>
-
wireframe .4 <enter>
-
Gire a molécula
para mostrar as duas histidinas. Vamos medir a distância entre elas;
digite na janela de comando:
-
Clique com o mouse no
carbono gama de uma das histidinas e depois no carbono gama da outra histidina.
Esta medida entre os átomos é mostrada em Ângstrons.
-
Você pode obter
uma lista completa dos comandos utilizados no Rasmol pegando o "Rasmol
Reference Card" AQUI.