São compostas de duas cadeias polipeptídicas associadas não-covalentemente: uma cadeia a de 32 a 34 kD e uma cadeia b de 29 a 32 kD. Ambas as cadeias das moléculas de classe II são codificadas por genes MHC polimórficos.

Nas moléculas da classe II a glicosilação do tipo N-linked ocorre nas duas cadeias polipeptídicas tendo aminoterminais extracelulares e carboxiterminais intracelulares, e mais de dois terços de cada cadeia estão localizados no espaço extracelular.

Os segmentos aminoterminais a 1 e b 1 das cadeias de classe II interagem para formar a fenda de ligação peptídica, que é estruturalmente semelhante à fenda das moléculas de classe I.

Quatro filamentos da base da fenda e uma das hélices são formados por a 1, e os outros quatro filamentos da base e a segunda hélice são formados por b 1. Os resíduos polimórficos estão localizados em a 1 e b 1, sobre e em volta da fenda de ligação do peptídeo, como acontece nas moléculas de classe I. SABER MAIS?

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