O estudo da RNA polimerase bacteriana é consideravelmente mais simples e fornece uma boa base para o entendimento de enzimas eucarióticas relacionadas.

A RNA polimerase sintetiza cadeias de RNA no sentido 5’ ® 3’, adicionando ribonucleotídeos na extremidade 3’ OH da fita em alongamento. Ao contrário da DNA polimerase, essa enzima não requer um primer ou iniciador para começar seu processo de síntese. Grande parte das cadeias de RNA recém-sintetizadas começam com pppG ou pppA (o grupo 5’-trifosfato não é clivado para liberar PPi, permanecendo intacto durante toda a transcrição), o que serve como marcação da ponta 5’. 

RNA pol de E. coli

Grande e complexa, a holoenzima RNA polimerase de E. coli possui 5 tipos de subunidades. Seu centro catalítico se encontra no chamado cerne da enzima (a₂bb’). E, além das funções  descritas no quadro1, a RNA polimerase também interage com proteínas ativadoras e repressoras que modulam a taxa de expressão gênica nas células. 

Quadro 1 - Subunidades da RNA polimerase de E.coli 

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