Neighbor Joining

• O método Neighbor Joining (NJ) é o mais popular na construção de árvores a partir de medidas de distâncias genéticas

(Saitou and Nei 1987, Mol. Biol. Evol. 4:406)

• NJ corrige o método UPGMA para seu pressuposto (frequentemente inválido) de que uma mesma taxa de evolução se aplica a todos ramos de uma filogenia.
• A matriz de distância é ajustada para diferenças nas taxas de evolução de cada táxon (ramo).
• NJ apresentou melhores resultados em simulações e é computacionalmente o mais eficiente algoritmo de distâncias (N. Saitou and T. Imanishi, Mol. Biol. Evol. 6:514 (1989)

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