Os promotores são seqüências de DNA específicas importantes para o início da transcrição. Tais seqüências são reconhecidas por algumas proteínas específicas, chamadas de fatores de transcrição, que trazem a RNA polimerase para realizar a montagem dos RNAs.

TATA box

O TATA box é um dos principais promotores eucarióticos conhecidos e encontra-se a 5' do ponto de início da transcrição da grande maioria dos genes.

Ele foi descoberto após a realização de vários estudos de footprinting, onde observava-se a ligação da enzima RNA polimerase II logo acima (upstream) do ponto de início da transcrição, em uma seqüência que era conservada entre diversos organismos. Essa seqüência localiza-se, normalmente, cerca de 25 nucleotídeos antes do local de início da transcrição e foi chamada de TATA box. A seqüência consenso consiste de um heptanucleotídeo composto por A’s e T’s e está presente em praticamente todos os genes de eucariotos que levam a produção de RNAs mensageiros.

O TATA box é semelhante à seqüência consenso –10 de procariotos (TATAAT) e freqüentemente é flanqueado por regiões ricas em G e C. Mutações nessa seqüência diminuem bastante a eficiência do promotor e diminuem a taxa de transcrição do gene. Mesmo mutações que mudem A’s para T’s podem gerar problemas, indicando que não só a porcentagem desses nucleotídeos é importante, como também a seqüência específica.

Outros sítios promotores

Além do TATA box, outras seqüências consenso são necessárias para a correta e eficiente transcrição de um gene, como os chamados CAAT box e GC box. Esses elementos são freqüentemente encontrados em regiões a cerca de 40 a 100 nucleotídeos acima do sítio de início da transcrição, ao contrário dos outros promotores procarióticos - que necessitam estar exatamente a 35 nucleotídeos desse ponto de início - e podem estar presentes em qualquer uma das fitas. 

Os GC boxes são formados por seqüências 5’ GGGCGG 3’ e estão relacionados a grande parte dos genes constitutivos (aqueles que são expressos sempre, não necessitando de regulação). Já os CAAT boxes são formados por sequências 5’ GGNCAATCT 3’.

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