Filogenia Molecular com DNA
Calculando distâncias genéticas
(a partir de sequências e frequências alélicas) e desenhando
árvores filogenéticas por vários métodos com
o pacote de programas
PHYLIP
Notas importantes:
-
os programas PHYLIP
estão zipados (clique aqui). Dezipe-os
no diretório c:\temp, os quais deverão ser rodados a partir
do Windows Explorer (mantenha este sempre aberto).
-
no mesmo diretório phylip estão
também os dois arquivos seguintes:
alelfreq.txt
(arquivo de frequências para 10 locus bialélicos em 5 populações)
mtseq.txt
(arquivos de 17 sequências de mtDNA incluindo o Neandertal)
-
leia atentamente o tutorial da prática
e tente visualizar as árvores primeiro com o programa Phylodendron
Tree Printer e posteriormente, caso haja problemas, poderá ser utilizado
um destes programas: Drawtree ou TreeView.
Faça
primeiro as árvores por método de parcimônia com o
arquivo mtseq.txt.
Clique aqui
para ver o tutorial da prática
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