DNA polimerase III:
Possui todas as características
que a DNA polimerase II tem similares a DNA
polimerase I. Além disso é
ela que sintetiza a maior parte do novo DNA.
Tem como característica alta
processividade, potência catalítica e fidelidade. Isso a
diferencia da DNA polimerase I que
tem como função o reparo
e preenchimento de
espaços, além de ter
uma processividade muito menos eficiente.
A DNA polimerase III não solta
o molde enquanto não for totalmente replicado.
Ela apresenta 10 tipos de cadeias
polipeptícas e tem uma massa de ~900 Kd.
Cada cerne é cataliticamente
ativo, mas não processivo. A processividade éconferida por
b2 e t2.
A holoenzima é um dímero,
pois ambos filamentos do DNA parental devem ser
replicados no mesmo lugar e ao mesmo
tempo. Entretanto os filamentos "leading e
lagging" são sintetizados diferentemente,
e portanto a holoenzima deve ser assimétrica.
As subunidades b tornam a holoenzima
altamente processiva por circundar o
molde de DNA.
O buraco de 35 A de diâmetro
em seu centro pode facilmente
acomodar uma molécula dúplex
de DNA.
O molde é captado, mas há
espaço suficiente entre o DNA e a proteína para
permitir o rápido deslizamento
e o DNA gira durante a replicação.
b2 tem um papel importante na replicação
servindo como grampo deslizante de
DNA já que a velocidade catalítica
e de 1000 nucleotídeos polimerizados por segundo,
requerendo o deslizamento de 100 voltas
do dúplex de DNA pelo buraco central de b2.
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