BioInformática:
- Informando-se sobre genes e proteínas:
- Pesquisando no Entrez: bibliografia, sequências, estrutura 3D, genomas (genoma humano)
- Pesquisando no OMIM, no UniGene ou tudo sobre um locus
- Pesquisando o mapa cromossômico humano de 1998 e vias bioquímicas
- Criando HomePages que apresentam sua pesquisa (modelo)
- Estudando coleções de sequências:
- Alinhamento de um grupo pequeno de sequências com MultiAlign
- Descarregando um grande número de sequências com BatchEntrez
- Formação de conglomerados de sequências com Icatools ou com Cap3
- Estimando distância evolutiva com Phylip
- Analisando genes:
- Pesquisando genes homólogos com Blast (programas e bancos)
- Desenhando primers, determinando sítios de restrição com NEBcutter e regiões de processamento de Introns
- Encontrando ORFs e avaliando o uso de códons
- Identificando Elementos Responsivos em promotores com Tess
- Analisando proteínas:
- Inferindo a sublocalização celular com Psort
- Prevendo estrutura secundária com PredictProtein
- Detectando domínios conservados com Pfam ou CDART e sítios de modificação pós-traducional com Prosite
- Receba e-mail do Swiss-Shop quando novas proteínas homólogas são depositadas
- Observando estrutura 3D com RasMol e modelando proteínas com SwissModel (veja) ou no SDSC
- Proteínas já modeladas podem ser vistas no 3D Crunch
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Miguel
Servidora Cromatina |
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Tchau mil beijos