Tutorial para desenhar árvores relacionando sequências
Primeiro salve algumas sequências de nucleotídeos de alguns cDNA para mioglobinas pesquisando assim no Entrez Nucleotide: [search for... myoglobin AND complete cds]; ou use sequências mitocondriais de aranha
Selecione as que preferir marcando o quadradinho, sem esquecer da página 2, e use: display [FASTA] clicando em [Text]. Salve o resultado no Temp como texto: mioglobinas.txt
Abra o arquivo com o Bloco de Notas (Iniciar > Programas > Acessórios > Bloco de Notas) e edite o nome de cada mioglobina (troque Gi pelo nome do organismo ou você vai ver só Gis no final). Depois selecione tudo e copie para usar a seguir.
Utilize as sequências em formato FASTA para rodar o Multalign e peça na página de resultado "result as a fasta file" e use este resultado para rodar o Phylip DNA dist e veja o resultado chamado "outfile". Copie o resultado todo sem perder o algarismo da primeira linha!
Use essa matriz para rodar o programa Phylip neighbor e copie o resultado chamado "outtree". Use-o para rodar o
programa desenhador de árvores. Veja que você pode escolher o tipo de árvore. Talvez seja melhor escolher como Output o formato: [GIF image map].
Sequências de aminoácidos podem ser usadas iniciando-se com o programa Phylip Prot dist
veja as sequencias de aranha alinhadas