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Veja que há bancos de dados de sequências de peptídeos e de nucleotídeos (mais abaixo)
Analise o banco não redundante "nr" de peptídeos. Ele junta as sequências presentes nos maiores bancos como:
- as traduções das regiões codificadoras (CDS) dos genes do GenBank
- as sequências das proteínas com estrutura 3D resolvida do banco de dados PDB e outros bancos importantes. O NCBI se esforça para retirar ao máximo a redundância desse banco, mas isso não é mais garantido, como foi no passado

Se você procurar sequências homólogas só no PDB, voce pode ter uma idéia da estrutura da sua proteína, não é mesmo?
Dos bancos de sequências de nucleotídeos destacamos o "nr" (coleção não redundante de vários bancos) e o dbEST
O banco dbEST é muito usado para descobertas gênicas in silico pois reúne sequências de cDNA "single run" de projetos genoma. As sequências, às vezes, são cheias de erro porque é "single run", mas a possível descobrir um gene de outra espécie
Exemplo: quando a sequência da Telomerase de um protozoário foi publicada, foi possível juntar várias ESTs humanas e deduzir a sequência da Telomerase humana
Vamos utilizar alguns programas. Volte para a página do BLAST com a seta de [back] do navegador e clique no tutorial [blastn] (janela ao lado)