O nível mais fundamental da organização da cromatina é uma unidade periódica e particulada, o nucleossomo, com uma extensão repetida de aproximadamente 200 bp de DNA.

No nucleossomo, o DNA dá duas voltas(aproximadamente 80 pb por volta) ao redor do centro octamêrico contendo duas das quatro histonas centrais, a H2A, H2B, H3 e H4. Este core é separado por uma variável extensão de DNA, o linker. Associada ao linker, há uma histona menos conservada, a H1.

A histona H1 localiza-se na entrada e na saída do DNA do nucleossomo. Utiliza uma parte do linker, completando as duas voltas no nucleossomo. Parece que a H1, de regiões ativas de transcrição, está parcialmente desligada.

Neste trabalho, o nocaute de H1 foi realizado em Tetrahymena themophila para observar o efeito na transcrição. Este protozoário contém dois núcleos: o macronúcleo, ativo no desenvolvimento vegetativo, possui H1 típica, codificada pelo gene HHO; e o micronúcleo, que é inerte na fase vegetativa. Neste micronúcleo, o linker tem associação com 4 proteínas(a b , g e d ) que formam um complexo referido como MIcLH codificadas pelo MLH.

Em um primeiro experimento, o peso seco de células nocauteadas(D H1 e D MicLH) não foi alterado. O RNA total foi isolado e medido por espectofotometria, obtendo valores maiores do que 1,8; indicando que o RNA está puro(sem proteína).

Para observar o efeito da RNA polI, o total de RNA de 10.000 células foi separado em um gel de agarose-formaldeído e corado com brometo de etídio. Uma única banda de rRNA, contendo 17S rRNA e duas metades juntas de 26S rRNA, é observada. Usando uma sonda para 26S rRNA em Northern blot, pequenas diferenças foram detectadas entre os tipos selvagem, D H1, D MicLH e D D LH. Portanto, transcritos de RNA polI não são afetados em células com deficiência em histonas do linker.

Assim como foi realizado o experimento para RNA polIII, pequenas diferenças foram observadas usando uma sonda polyT para detectar transcritos poly A⁺, e, consequentemente, o efeito na transcrição pela RNA polII.

O RUN-ON, teste em que a meia vida do mRNA não é considerada, foi realizado para testar se a transcrição aumenta e se a meia vida do mRNA diminui na mesma proporção.

O próximo procedimento foi examinar genes indutíveis através de análises de Northern blot e RUN-ON.

O gene ngoA, testado, pode ser detectado em células carenciads, mas não em células em crescimento. Após o nocaute, células carenciadas continuaram tendo uma alta expressão deste gene e as células em crescimento passaram a apresentar um nível basal de expressão quando o nocaute foi D H1 e D D LH. No controle e no D MicLH, não houve expressão do ngoA. Portanto, a histona H1 pode funcionar como um repressor específico in vivo.

A CyP(cisteína protease), como a ngoA, é induzida em células carenciadas e reprimida em células em crescimento, mas não por H1. O gene CyP diminui transcrição e a histona H1 pode funcionar como ativadora deste gene na transcrição in vivo.

Concluindo, não há efeitos globais na transcrição. A taxa de transcrição para RNA polI, RNA polII e RNA polIII é a mesma para as células tipo selvagem e as células nocauteadas. As histonas do Linker podem participar de repressão e ativação.